中大新聞網(wǎng)廣州11月16日電（通訊員李鍶鐸、熊麗娜）近日，2022國際基因工程機(jī)器大賽(International Genetically Engineered Machine Competition, iGEM)落下帷幕。我校生命科學(xué)學(xué)院兩支本科生參賽隊(duì)伍，憑借嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶?shí)驗(yàn)結(jié)果、流暢的線上演講答辯和生動(dòng)有趣的視頻展示得到大賽評委專家的認(rèn)可，其中SYSU-Software斬獲金牌，SYSU-CHINA收獲銀牌，再次在國際舞臺(tái)上展現(xiàn)中大學(xué)子的風(fēng)采。
本次比賽共有來自麻省理工學(xué)院、耶魯大學(xué)、哈佛大學(xué)、清華大學(xué)、北京大學(xué)、中山大學(xué)等國內(nèi)外知名學(xué)府共350支隊(duì)伍參賽。由于疫情影響，比賽于10月26日至28日以法國巴黎現(xiàn)場和遠(yuǎn)程線上結(jié)合的模式舉行。
中山大學(xué)軟件隊(duì)（SYSU-Software）成員包括來自生命科學(xué)學(xué)院的李鍶鐸、王元瑾、陳佳芃、程一諾、馮瑜輝、李慧彬、李凱、童馨潔、伍周穎、張?zhí)@銘，計(jì)算機(jī)學(xué)院的黃靖云、王童、許鴻鑫、許遵楠、楊天行、鄭中淳，數(shù)學(xué)學(xué)院的龔立言，傳播與設(shè)計(jì)學(xué)院的簡子喬，生態(tài)學(xué)院的徐微，環(huán)境科學(xué)與工程學(xué)院的李心妍、邱文君等，不同學(xué)科背景的同學(xué)聚在一起激起創(chuàng)新思維的火花。在生命科學(xué)學(xué)院楊建華教授等老師的指導(dǎo)下，團(tuán)隊(duì)閱讀大量文獻(xiàn)，走訪不同實(shí)驗(yàn)室，抓住尋找原核生物新型的抗病毒基因的學(xué)術(shù)前沿話題，充分運(yùn)用合成生物學(xué)的思維方式和研究手段，結(jié)合大數(shù)據(jù)、人工智能算法和機(jī)器學(xué)習(xí)等開發(fā)出原核生物抗性系統(tǒng)搜索及預(yù)測平臺(tái)“LOUPE”（http://sysu-software.com），主要目標(biāo)是從巨大的微生物基因組中發(fā)現(xiàn)新的防御系統(tǒng)及防御基因。應(yīng)用“LOUPE”軟件于大規(guī)模的微生物基因組數(shù)據(jù)中，挖掘出大批新的防御基因，最后利用濕實(shí)驗(yàn)初步驗(yàn)證了這些基因的潛在防御功能。該項(xiàng)目為研究者尋找潛在基因編輯工具和理解噬菌體-宿主相互競爭機(jī)制提供了新的方法。
SYSU-Software今年項(xiàng)目LOUPE的Wiki主頁
https://2022.igem.wiki/sysu-software/
LOUPE 軟件的工作流程圖
中山大學(xué)實(shí)驗(yàn)隊(duì)（SYSU-CHINA）的成員包括來自生命科學(xué)學(xué)院的曾旭明、鄔雅萱、凌嘉駿、周琪皓、邊靖元、羅珺文、陳一博、何欣樂、田嘉源、王志威、王泓戈、孫華為，藥學(xué)院的鄭嘉怡和中山醫(yī)學(xué)院的趙樂容。在劉建忠教授的指導(dǎo)下，團(tuán)隊(duì)成員分工合作，通過合成生物學(xué)方法，致力于應(yīng)用微生物共催化工程的紅景天苷合成。在接近一年的比賽過程中，團(tuán)隊(duì)從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)出發(fā)，先后完成了工程驗(yàn)證（Engineering success）和概念驗(yàn)證（Proof of concept）等內(nèi)容，并通過Alphafold2預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)，輔以分子動(dòng)力學(xué)模擬，酶動(dòng)力學(xué)模擬等分析方法為濕實(shí)驗(yàn)提供幫助。團(tuán)隊(duì)的工作為酪氨酸衍生物的合成與共催化工程的應(yīng)用積累了寶貴的經(jīng)驗(yàn)。
SYSU-CHINA今年項(xiàng)目ACCESS的Wiki主頁
https://2022.igem.wiki/sysu-china/
項(xiàng)目相關(guān)的分子對接與分子動(dòng)力學(xué)模擬實(shí)驗(yàn)
本次賽事得到學(xué)校國際合作與交流處、教務(wù)部、團(tuán)隊(duì)師生所在學(xué)院等單位的大力支持和廣東省人民醫(yī)院檢驗(yàn)科的幫助。中大軟件隊(duì)自2012年參賽以來，八次獲得大賽金獎(jiǎng)，其中四次問鼎全球軟件項(xiàng)目組世界冠軍(Best Software)，還曾獲得過最佳應(yīng)用設(shè)計(jì)獎(jiǎng)提名和最佳數(shù)學(xué)建模獎(jiǎng)提名，是全球軟件項(xiàng)目組中獲得冠軍次數(shù)最多的一支隊(duì)伍。中大實(shí)驗(yàn)隊(duì)自2011年參賽以來，七次獲得大賽金獎(jiǎng)，三次獲得銀獎(jiǎng)，曾獲得Best New Biobrick Part、Best New Composite Part、Best Model等單項(xiàng)大獎(jiǎng)，曾在全球決賽中位列世界第二。
文稿終審：生命科學(xué)學(xué)院 張斯虹
